Οι φυσικές διεργασίες χρησιμοπιούνται κατά κόρο στη βιομηχανία των τροφίμων τόσο στην παραγωγική διαδικασία όσο και στην εξοικονόμηση ενέργειας. Το πλεονέκτημά τους είναι ότι θεωρούνται πιο φιλικές από τις χημικές διεργασίες από πλευράς της προστασίας της υγείας των καταναλωτών. Σαν αποτέλεσμα έχουν τα τελευταία χρόνια αντικαταστήσει αρκετές χημικές διεργασίες.

φυσικές διεργασίες, απόσταξη, ανάμιξη, φυγοκέντριση, διήθηση, ξήρανση, εναλλάκτες θερμότητας, εξευγενισμός, συμπύκνωση, κρυστάλλωση.